394-ONLINE NATUURLEZING De Merel en M.U.S. (Meetnet Urbane Soorten van Sovon)

'Grondleggers van de ecologie'

Om die vragen te beantwoorden begin ik een korte serie 'Grondleggers van de ecologie' in de podcast Toekomst voor Natuur, samen met botanisch filosoof @norbertbotanischfilosoof.

De eerste aflevering van de serie gaat over Carl Linnaeus (1707-1778), een bizar veelzijdig man. Was hij de eerste ecoloog? Je hoort het zaterdagochtend in 'Toekomst voor Natuur' op jouw favoriete podcastplatform!
podcast toekomstvoornatuur #vlinderstichting ecologie #grondleggers #carllinnaeus #linnaeus #happylistening

Diemer Vercayie @diemer839 van @natuurpunt vertelt er je alles over. Natuurorganisaties maakten in de afgelopen decennia een grote communicatiefout. Wete welke? Beluister het nu op jouw favoriete podcastplatform!

podcast #toekomstvoornatuur #vlinderstichting #natuurpunt #zoogdieren #wolf #wolffencing #vlaanderen
1 w.

https://www.bnr.nl/podcast/57/10421055/57-met-ruud-koornstra Hij deed en doet van alles; zo was hij ooit tv-producent, nu is hij ondernemer, een groene ondernemer. Ondertussen is hij nationale energiecommissaris. Dat vindt hij belangrijk, want die hemel op aarde begint met de energietransitie. Hoe? Dat vertelt hij aan Roelof. Alles wat Ruud in zijn leven heeft gedaan, draagt bij aan zijn missie. Zo halverwege de vijftig rustig nadenken over afbouwen? Ben je gek! Het begint nog maar net.

Occupancy models are useful for estimating species’ distributions and relationships between species occurrence and habitat or landscape variables (among many other things!).

A basic occupancy model estimates two parameters:
https://jamesepaterson.github.io/jamespatersonblog/2020-09-01_occupancyintroduction.html et’s build some basic single-season occupancy models with the unmarked package!

The basic single-season form assumes that occupancy status (presence or absence) does not change during the study. That is, a species is either always present or always absent at each site, even if the species is not always detected. Dynamic occupancy models allow occupancy status at a site to change through colonization and extinction.

To get started, we need data describing on which surveys that a species was detected. We will use some sample data I simulated. The unmarked package uses a special object type to organize detection data and covariates (an unmarkedFrameOccu).

UITNODIGING
Natuurlezing door Jan Schoppers & Willem Kuijsten
De Merel en M.U.S. (Meetnet Urbane Soorten van Sovon)

dinsdag 24 januari 2023 (LET OP! 4e dinsdag)
Live in Het Groene Huis

De merel; wat ooit een schuwe bosvogel was veranderende in een algemene
tuinvogel. Maar nu lijkt zelfs die algemene tuinvogel niet meer zo algemeen
te zijn. Wat is daar aan de hand? Kennis over het voorkomen van de merel
wordt onder andere verzameld via M.U.S. (Meetnet Urbane Soorten).
Vrijwilligers tellen volgens een vaste methode welke vogels er bij hen in de
wijk voorkomen. Vogeldeskundige Jan Schoppers van SOVON vertelt meer over de
merel en M.U.S. . Aanvullend daarop vertelt stadsecoloog Willem Kuijsten hoe
die informatie gebruikt wordt bij het beschermen van de natuur in de stad.

Begin vorige eeuw beschreef Jac. P. Thijsse - één van de oprichters van
Natuurmonumenten - de merel als een schuwe bosvogel. Maar hij nam in die
tijd ook waar dat steeds meer merels in Nederland bleven. De eeuw
daaropvolgend veranderde de merel tot een echte cultuurvolger, inmiddels de
talrijkste broedvogel. Én de meest bekende vogel van ons land. Bij de
jaarlijkse tuintelling van de Vogelbescherming staat de merel al jaren in de
top 3. Het jaar 2022 was 'het jaar van de merel'. Helaas stierven in dat
jaar veel merels door het usutu-virus. Hoe gaat het nu met de door ons zo
gewaardeerde vogel met zijn melodieuze zang?

'Meten is weten' gaat ook op voor kennis over vogels. Om de
populatieontwikkeling van wilde vogels over langere termijn te onderzoeken
zijn betrouwbare monitoringsprogramma's essentieel. M.U.S (Meetnet Urbane
Soorten) is zo'n monitoringsprogramma voor vogels in steden. Om de natuur in
de stad te beschermen bij bouwactiviteiten, met name de huismus en de
gierzwaluw, heeft de gemeente Amersfoort een Soort Management Plan (S.M.P
2023-2032) opgesteld. De gemeente gaat M.U.S. gebruiken als onderdeel van
het S.M.P.

Naast huismus en gierzwaluw worden met M.U.S. jaarlijks ook trends berekend
voor alle andere soorten die in de stad Amersfoort voorkomen, zoals de
merel. Door middel van M.U.S. krijg je een beeld hoe het gaat met een groot
aantal broedvogelsoorten. Het allerleukste en interessante van M.U.S. is dat
het iets is waaraan iedereen kan meedoen! Hoe? Ook dat komt aan de orde.

De lezing wordt georganiseerd door Werkgroep Natuurlezingen Amersfoort, een
samenwerkingsverband van KNNV, IVN, Vogelwacht Utrecht en Gemeente
Amersfoort.
De lezing is ook online te volgen

'Grondleggers van de ecologie'

Om die vragen te beantwoorden begin ik een korte serie 'Grondleggers van de ecologie' in de podcast Toekomst voor Natuur, samen met botanisch filosoof @norbertbotanischfilosoof.

De eerste aflevering van de serie gaat over Carl Linnaeus (1707-1778), een bizar veelzijdig man. Was hij de eerste ecoloog? Je hoort het zaterdagochtend in 'Toekomst voor Natuur' op jouw favoriete podcastplatform!
podcast toekomstvoornatuur #vlinderstichting ecologie #grondleggers #carllinnaeus #linnaeus #happylistening

Diemer Vercayie @diemer839 van @natuurpunt vertelt er je alles over. Natuurorganisaties maakten in de afgelopen decennia een grote communicatiefout. Wete welke? Beluister het nu op jouw favoriete podcastplatform!

podcast #toekomstvoornatuur #vlinderstichting #natuurpunt #zoogdieren #wolf #wolffencing #vlaanderen
1 w.

https://www.bnr.nl/podcast/57/10421055/57-met-ruud-koornstra Hij deed en doet van alles; zo was hij ooit tv-producent, nu is hij ondernemer, een groene ondernemer. Ondertussen is hij nationale energiecommissaris. Dat vindt hij belangrijk, want die hemel op aarde begint met de energietransitie. Hoe? Dat vertelt hij aan Roelof. Alles wat Ruud in zijn leven heeft gedaan, draagt bij aan zijn missie. Zo halverwege de vijftig rustig nadenken over afbouwen? Ben je gek! Het begint nog maar net.

Occupancy models are useful for estimating species’ distributions and relationships between species occurrence and habitat or landscape variables (among many other things!).

A basic occupancy model estimates two parameters:
https://jamesepaterson.github.io/jamespatersonblog/2020-09-01_occupancyintroduction.html et’s build some basic single-season occupancy models with the unmarked package!

The basic single-season form assumes that occupancy status (presence or absence) does not change during the study. That is, a species is either always present or always absent at each site, even if the species is not always detected. Dynamic occupancy models allow occupancy status at a site to change through colonization and extinction.

To get started, we need data describing on which surveys that a species was detected. We will use some sample data I simulated. The unmarked package uses a special object type to organize detection data and covariates (an unmarkedFrameOccu).

UITNODIGING
Natuurlezing door Jan Schoppers & Willem Kuijsten
De Merel en M.U.S. (Meetnet Urbane Soorten van Sovon)

dinsdag 24 januari 2023 (LET OP! 4e dinsdag)
Live in Het Groene Huis

De merel; wat ooit een schuwe bosvogel was veranderende in een algemene
tuinvogel. Maar nu lijkt zelfs die algemene tuinvogel niet meer zo algemeen
te zijn. Wat is daar aan de hand? Kennis over het voorkomen van de merel
wordt onder andere verzameld via M.U.S. (Meetnet Urbane Soorten).
Vrijwilligers tellen volgens een vaste methode welke vogels er bij hen in de
wijk voorkomen. Vogeldeskundige Jan Schoppers van SOVON vertelt meer over de
merel en M.U.S. . Aanvullend daarop vertelt stadsecoloog Willem Kuijsten hoe
die informatie gebruikt wordt bij het beschermen van de natuur in de stad.

Begin vorige eeuw beschreef Jac. P. Thijsse - één van de oprichters van
Natuurmonumenten - de merel als een schuwe bosvogel. Maar hij nam in die
tijd ook waar dat steeds meer merels in Nederland bleven. De eeuw
daaropvolgend veranderde de merel tot een echte cultuurvolger, inmiddels de
talrijkste broedvogel. Én de meest bekende vogel van ons land. Bij de
jaarlijkse tuintelling van de Vogelbescherming staat de merel al jaren in de
top 3. Het jaar 2022 was 'het jaar van de merel'. Helaas stierven in dat
jaar veel merels door het usutu-virus. Hoe gaat het nu met de door ons zo
gewaardeerde vogel met zijn melodieuze zang?

'Meten is weten' gaat ook op voor kennis over vogels. Om de
populatieontwikkeling van wilde vogels over langere termijn te onderzoeken
zijn betrouwbare monitoringsprogramma's essentieel. M.U.S (Meetnet Urbane
Soorten) is zo'n monitoringsprogramma voor vogels in steden. Om de natuur in
de stad te beschermen bij bouwactiviteiten, met name de huismus en de
gierzwaluw, heeft de gemeente Amersfoort een Soort Management Plan (S.M.P
2023-2032) opgesteld. De gemeente gaat M.U.S. gebruiken als onderdeel van
het S.M.P.

Naast huismus en gierzwaluw worden met M.U.S. jaarlijks ook trends berekend
voor alle andere soorten die in de stad Amersfoort voorkomen, zoals de
merel. Door middel van M.U.S. krijg je een beeld hoe het gaat met een groot
aantal broedvogelsoorten. Het allerleukste en interessante van M.U.S. is dat
het iets is waaraan iedereen kan meedoen! Hoe? Ook dat komt aan de orde.

De lezing wordt georganiseerd door Werkgroep Natuurlezingen Amersfoort, een
samenwerkingsverband van KNNV, IVN, Vogelwacht Utrecht en Gemeente
Amersfoort.
De lezing is ook online te volgen

593 weergaven 30 nov 2021
Dit verhaal gaat over een paradox: terwijl insecten in West-Europa de afgelopen decennia met wel 75% zouden zijn afgenomen, is er bij veel insectivore vogelsoorten nauwelijks afname te zien over dezelfde periode. Soorten als zwartkop, nachtzwaluw en roodborsttapuit zijn de afgelopen 30 jaar minstens verdubbeld, en zelfs boerenzwaluw en bonte vliegenvanger hebben na klappen in de jaren ‘90 de afgelopen jaren weer hun oude aantallen bereikt. Waarom zien we die achteruitgang van insecten dan niet terug in broedvogeltrends? Een mogelijke verklaring is dat veel van deze vogelsoorten (nog) niet door hun voedsel in Nederland beperkt worden, maar bijvoorbeeld door omstandigheden tijdens de winter. Een andere verklaring is dat het voedsel dat voor deze soorten belangrijk is veel minder (of niet) is afgenomen. Er is duidelijk werk aan de winkel om beter te begrijpen welk voedsel belangrijk is voor soorten, en of dit werkelijk afneemt.

Onder deelnemers is een enquête gehouden. Hieruit bleek dat de grote meerderheid tevreden was over dit nieuwe format. Meewind zal de vergadering van 2023 dan ook weer op deze manier organiseren.

https://onlinelibrary.wiley.com/share/ZHQTBHHSYHITEZZNYMGV?target=10.1111/j.1654-1103.2010.01247.x

https://bsapubs.onlinelibrary.wiley.com/share/YMDXUWKTUG5C5D8JMVFA?target=10.3732/ajb.1000215

Hopefully that’s helpful, if you and @graysquirrel want to explore this more let me know. Given your extensive sampling in the park it might be fun to make a case study out of thi
https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/share/MCVZMJUX5UNNE9HRTXTP?target=10.1111/2041-210X.12841

https://cran.r-project.org/web/packages/SSDM/index.html

This one is a bit more colourfull https://www.evolution.unibas.ch/walser/bacteria_community_analysis/2015-02-10_MBM_tutorial_combined.pdf 1

On the forum on bias etc
Biases in iNat data - General - iNaturalist Community Forum 1
How to distinguish increased observations of a species from overall increased observations - General - iNaturalist Community Forum 1

Occupancy models in R Part 2: model comparisons (jamesepaterson.github.io)

You might be interested in rarefaction analyses that can help in partially taking into account varying observer effort across states. See the iNEXT package and this paper https://doi.org/10.1111/2041-210X.12613 .

https://forum.inaturalist.org/t/some-choropleth-maps-using-inat-data/21776/2
https://www.researchgate.net/post/How-to-interpret-Chao1-and-Chao2-values
https://cran.r-project.org/web/packages/iNEXT/vignettes/Introduction.pdf
https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/2041-210X.12613

https://www.ethicaldesert.com/coloradocactus 1 @ ethica ldesert

https://www.amazon.com/Dr-Shaun-Michael-McCoshum/dp/B09YNBMP8Z/ref=mp_s_a_1_1?crid=2I64CZJOZV3A9 4 @ Shaun Michael

The bees in your backyard by Wilson and Messinger Carril @ sturn ella

Flora of Colorado @ jackerf ield

Extra aanbod in de Herfstvakantie

Reisorganisatie Sunweb komt terug op Groningen Airport Eelde en biedt van 21 tot 28 oktober 2023 (herfstvakantie-Noord) de bestemmingen Antalya (Turkije), Bodrum (Turkije) en Rhodos (Griekenland) aan.

PowerPoint iNat Talks

Here is a link to a powerpoint presentation that I made and sometimes modify for presentations about inaturalist: https://drive.google.com/file/d/1bqiz6b1QgJr6wVIA2F906U-5txKsvdSu/view?usp=sharing 29
I have also broken them into others that are visible in this folder: https://drive.google.com/drive/folders/1SIPJ3D6uG3HrHporAyRldC1Y_JwDy37i?usp=sharing 10

If you find any of these documents useful, feel free to share them with anyone who wants to learn about iNat :-)

? De lezingen van vorig jaar zijn nog wel allemaal na te zien, o.a. via youtube. Het verhaal van regenwormenonderzoek was vanmiddag al, dus die heb ik gemist. In deze entoLIV serie komen nog tien lezingen van de Biological Recording Company.
https://www.provincieantwerpen.be/aanbod/dlm/samenwerkingsverbanden/ankona/ankona-ontmoetingsdagen.html
https://www.youtube.com/watch?v=7FgTmaIQeg0&t=24s
https://platformwow.nl/reeksen-archief/climate-adaptation-solutions-from-different-corners-of-the-world

The talk will be recorded so you’ll be able to catch up on YouTube. Subscribe to my YouTube channel to be notified when the recording is uploaded: https://www.youtube.com/channel/UCbeFlKCmJl3h05j4dc9bu1Q

Despite the rich bird life in the eastern Amazon basin, relatively little research has been conducted in the Belém Area of Endemism in northeastern Brazil – one of at least eight regions in Amazonia with unique species found only in each of these respective areas. The Belém area is the most endangered of the eight, largely because of deforestation that has left just 24% of primary forest standing. Jason Weckstein, associate curator of Ornithology at Philadelphia’s Academy of Natural Sciences of Drexel University, will take us on an armchair expedition into this very special location, where he co-led a team conducting research to discover and describe the bird and bird parasite diversity in the region. He’ll share an up-close-and-personal look at everything from daily life in the field to the area’s biodiversity, the endemism patterns in birds and their associated parasites found there, and how the team’s findings are being used to advance our understanding of speciation, disease and parasite ecology, and conservation.

About the Speaker: Jason D. Weckstein, PhD, is Associate Curator of Ornithology at the Academy of Natural Sciences of Drexel University and Associate Professor in Department of Biodiversity, Earth and Environmental Sciences at Drexel University. His research focuses on the biology, biodiversity and evolutionary history of birds and their parasites. He is a fellow of the American Ornithological Society, and has over 20 years of experience working in natural history museums. He has conducted research on birds and their parasites in the United States, Canada, South Africa, Ghana, Malawi, Nicaragua, Brazil, and Mexico.

Using bats and their associated parasites as a case study, Dr. Speer examines how environmental and host factors contribute to microbiome community composition and pathogen prevalence, and how natural history collections capture these interactions. In bats, the skin microbiome appears to vary with environment, while parasites tend to have highly species-specific microbiomes. However, to a lesser extent, habitat fragmentation, time, and geography contribute to variation in the microbiome of parasites.

Additionally, Dr. Speer explores how existing specimens in natural history collections may provide historical context for bat-pathogen and bat-parasite interactions. Studies of host-parasite-microbiome assemblages are necessary to advance our understanding of disease ecology and emergence in wildlife, especially given the wildlife origin of pathogens that impact human health and well-being. Natural history collections are uniquely suited to capture the complexities of wildlife interactions and, using new tools to detect microorganisms from these collections, can inform One Health research in the process.

This event is free and open to all. https://www.eventbrite.co.uk/e/wriggling-into-recording-10-yrs-of-the-national-earthworm-recording-scheme-tickets-236697236807

• 0:00 Introductie: Welkom op de feesteditie 25 jaar ANKONA
  Dirk Vandenbussche (provincie Antwerpen)

• 7:33 COVID19, kunnen mensen andere (zoog)dieren infecteren?
  Luc De Bruyn (INBO)

• 2:06:06 Vernieuwde lijst provinciaal prioritaire soorten voor provincie Antwerpen
  Dirk Maes (INBO) en Dirk Vandenbussche (provincie Antwerpen)

• 2:53:03 Camera-opstelling slechtvalkkast Provinciehuis
  Mieke Hoogewijs (Provincie Antwerpen)

• ANKONA2022 Deel 2/4 - Themadag Monitoring
  Opname van het tweede deel van de ANKONA-ontmoetingsdagen 2022. De webinar ging door op maandag 14 februari met als thema monitoring. Geniet hier van de volgende lezingen:

  0:00 Opstart vismonitoring
  Chris Van Liefferinge (Provincie Antwerpen)

19:27 Monitoring van de Aziatische hoornaar in Vlaanderen
Jasmijn Hillaert (INBO)

31:30 Monitoring van de Aziatische hoornaar in Vlaanderen
Patrick Van Ende (Lokale vrijwilliger in Antwerpen)

• 0:00 Introductie:
  
  Dirk Vandenbussche (provincie Antwerpen)

• 2:27 Ecologie boommarter
  Michiel Cornelis (Natuurpunt Zoogdierenwerkgroep)

• 13:00: Stageverslag 2021, met wildcamera-uitleg en technische aspecten, Den Inslag en omgeving
  Jasper Gijsel (stagestudent UA van Michiel Cornelis)

• ANKONA2022 Deel 4/4 - Themadag Verwondering

  Opname van het vierde deel van de ANKONA-ontmoetingsdagen 2022. De webinar ging door op woensdag 16 februari met als thema verwondering. Geniet hier van de volgende lezingen:

• 0:00 Afsluiting Feesteditie 25 jaar ANKONA
  gedeputeerde Jan De Haes (Provincie Antwerpen)

• 6:58 "Diersporen: vinden, verzamelen, nut, waarde en verhalen"
  René Nauta (bushcraftexpert en auteur van het boek 'Het Prentenboek' over diersporen van dieren uit Noordwest-Europa)

• 1:00:44 Slotwoord
  Dirk Vandenbussche (Provincie Antwerpen)

• 33:51 Stageverslag 2021, met vergelijking van stage uit boommarterstudie uit 2018, Grenspark Kalmthoutse Heide
  Romeo Liekens (stagestudent UA van Rudi Delvaux)

• 45:36 Boommarters individueel herkennen en opvolgen
  Christoffel Bonte (Natuurpunt)

• 1:16:28 Van monitoring naar ontsnipperingsmaatregelen langs de Antitankgracht
  Anne Stuer (RL de Voorkempen)

• 1:26:10 Stageverslag 2021: Ontsnipperingsmaatregelen langs de Antitankgracht, klaar voor uitvoering.
  Ward Van Herck (stagestudent Thomas More bij Anne Stuer)